Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rundc1Q0VDN7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rundc1Q0VDN7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms