Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Itgb8Q0VBD0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms