Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab42Q0PD08 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms