Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TrioQ0KL02 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TrioQ0KL02 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms