Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Pate4Q09098 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms