Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
1700061G19RikQ08EE8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
1700061G19RikQ08EE8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms