Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cass4Q08EC4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms