Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gata4Q08369 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms