Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col17a1Q07563 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col17a1Q07563 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms