Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms