Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Siah1bQ06985 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms