Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3bp2Q06649 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sh3bp2Q06649 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms