Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Caprin2Q05A80 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Caprin2Q05A80 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms