Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Thbs3Q05895 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms