Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fmn1Q05860 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms