Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Col6a1Q04857 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms