Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smpd1Q04519 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smpd1Q04519 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms