Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Scg2Q03517 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms