Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tff2Q03404 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms