Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx2Q03358 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx2Q03358 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms