Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Pax5Q02650 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms