Protein–RNA interactions for Protein: Q02248

Ctnnb1, Catenin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnb1Q02248 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnb1Q02248 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctnnb1Q02248 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms