Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Uba1Q02053 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Uba1Q02053 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms