Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RykQ01887 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RykQ01887 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
RykQ01887 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms