Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cacna1cQ01815 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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