Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Col1a2Q01149 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Col1a2Q01149 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms