Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Grin2bQ01097 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Grin2bQ01097 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms