Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
PrcdQ00LT2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms