Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Rbp4Q00724 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms