Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HmmrQ00547 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmmrQ00547 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmmrQ00547 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmmrQ00547 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmmrQ00547 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmmrQ00547 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HmmrQ00547 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms