Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gabpb1Q00420 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gabpb1Q00420 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gabpb1Q00420 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gabpb1Q00420 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gabpb1Q00420 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gabpb1Q00420 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gabpb1Q00420 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gabpb1Q00420 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gabpb1Q00420 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gabpb1Q00420 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gabpb1Q00420 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gabpb1Q00420 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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