Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx2Q00262 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Stx2Q00262 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx2Q00262 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx2Q00262 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx2Q00262 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx2Q00262 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx2Q00262 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx2Q00262 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx2Q00262 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stx2Q00262 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stx2Q00262 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Stx2Q00262 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx2Q00262 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx2Q00262 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx2Q00262 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx2Q00262 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Stx2Q00262 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx2Q00262 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Stx2Q00262 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx2Q00262 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx2Q00262 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms