Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited1P97769 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Cited1P97769 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms