Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nbr1P97432 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nbr1P97432 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms