Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pkp1P97350 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pkp1P97350 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms