Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Mesp1P97309 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms