Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Vgll3P85442 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Vgll3P85442 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms