Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gabpb2P81069 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms