Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tp53bp1P70399 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tp53bp1P70399 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms