Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vamp7P70280 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vamp7P70280 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms