Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NfixP70257 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NfixP70257 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfixP70257 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfixP70257 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfixP70257 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms