Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SbdsP70122 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms