Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rpl18aP62717 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms