Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Snrpd1P62315 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Snrpd1P62315 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms