Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ufm1P61961 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms