Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ube2nP61089 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms