Protein–RNA interactions for Protein: P57016

Lad1, Ladinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lad1P57016 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lad1P57016 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Lad1P57016 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Lad1P57016 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lad1P57016 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms