Protein–RNA interactions for Protein: P56567

Csta, Cystatin-A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CstaP56567 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CstaP56567 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CstaP56567 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CstaP56567 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CstaP56567 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CstaP56567 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms