Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gp1bbP56400 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms