Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Atp5eP56382 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms